Gli interni del complesso di Sant’Agata presentano situazioni conservative tra loro alquanto diversificate. I principali materiali in opera sui quali si è intervenuti sono MATERIALI LAPIDEI, INTONACO, DIPINTI MURALI e LEGNO (laccato e policromo). Gli intonaci versavano in un avanzato stato di degrado con ampie aree distaccate dal substrato a causa della disgregazione del materiale e delle efflorescenze sottostanti. Presenza di numerose macchie soprattutto sui soffitti, probabilmente dovute a infiltrazioni (da verificare se ancora attive). Molteplici fessurazioni si ritrovano generalmente su tutta la superficie intonacata. I dipinti murali, a causa dell’umidità presente nelle murature, presentavano polverizzazione dello strato pittorico con conseguente caduta e perdita di materiale. Questo provoca la formazione di numerose lacune che incidono negativamente sulla leggibilità delle opere. Presenza di numerose fessurazioni ed efflorescenze visibili ad occhio nudo. Gli altari in materiale lapideo versavano in discrete condizioni, con presenza di deposito superficiale incoerente al substrato. I legni policromi hanno problematiche legate alla presenza di insetti xilofagi che provocano l’indebolimento interno della struttura. I legni verniciati invece presentavano caduta di materiale e distacchi dello strato superficiale di pittura.